Здравствуйте. Ситуация следующая
В debian, устанавливается софт, из пакета! Далее с этим софтом работают пользователи, база растет. Далее надо обновить пакет, тоже с новыми данными в базе.
Каким образом объединить эти базы?
На какие нюансы/детали, при реализации этой задачи, следует обратить внимание?
Этот вопрос вам надо задать
Этот вопрос вам надо задать разработчикам ПО. У нормальных разработчиков есть процедуры миграции с версии на версию, которые накатывают обновления не затирая старые данные.